Как правило, болезни культурных растений возникают вследствие поражения микроорганизмами. Типичными возбудителями болезней культурных растений являются грибы, бактерии и вирусы. Известно, что эти живые существа существуют на планете уже очень давно, и решающим образом влияют на развитие растительного и животного мира. Мельчайшие организмы сформировали ту природу, которую мы сегодня можем наблюдать и использовать. Они распространяются на участках и массивах, занятых сельскохозяйственными культурами, когда для этого возникают благоприятные условия. Болезнетворные микроорганизмы вследствие своей жизнедеятельности распространяются в организмах растений и используют их тело как материал для собственного развития и размножения. Например, споры мельчайших грибов, которые вызывают поражения растений паршой или мучнистой росой, прорастают в каплях воды, которые выпадают на листья, и распространяются на клетки, находящиеся вблизи, и в межклеточное пространство.

Вследствие разрастания спор возникает колония патогенного гриба, которую можно заметить в виде темно-коричневой или черного пятна или круги на листке — такую ??колонию называют « конидии ». Конидии способны распространять следующие споры на достаточно большое расстояние с помощью ветра и насекомых, переносящих гриб во время своего перемещения на массиве или вследствие особенностей своей жизнедеятельности. Особенно активно переносят возбудителя монилиозу — плодовой гнили — бабочки яблонной плодожорки, а затем их личинки. Бактериальные поражения часто происходит локально в виде бактериального ожога листьев, стеблей и даже тонких ветвей на ягодных и плодовых культурах. Это означает, что патогенные бактерии активизировались в чрезвычайно благоприятных для себя условиях.

Вирусные заболевания встречаются не так часто, как бактериальные или грибковые, однако лечить и предотвращать их распространение очень сложно в связи с природой вирусов: они традиционно селятся внутри клеток и распространяются чрезвычайно быстро, иногда истребляя целые массивы ягодных культур на протяжении нескольких лет, а овощей — за один сезон. Для эффективного сдерживания болезней растений нужно использовать антагонистические микроорганизмы, которые являются основой биопрепаратов фунгицидной действия .