Использование микроскопических водорослей в качестве биоиндикаторов является перспективным направлением в независимом мониторинга состояния загрязнения водоемов сточными водами . Биологический анализ воды делают за наличием и количественным представлением видов-индикаторов сапробности, или загрязнения. Следует отметить, что на разных участках реки видовой состав водорослей может существенно изменяться и, соответственно, меняется зона сапробности. Так, в этом году воспитанники кружка «Эколог» Шосткинского городской станции юных натуралистов изучали степень загрязнения г. Шостка по индикаторным микроскопическими водорослями в пределах Свемивського микрорайона, центральной экспозиции русла , до попадания вод из очистных сооружений и некоторых промышленных предприятий.
Отбор проб по таким экологическим группам: планктон (организмы, существующие в толще воды), перифитон (водоросли, которые живут на предметах , удаленных от дна) и бентос (организмы, приспособленные к существованию в прикрепленном и неприкрепленном состоянии на дне водоемов). Анализ воды на данном участке реки показал умеренное загрязнение воды. Основными источниками загрязнения были хозбытовые стоки населенных пунктов района, а именно с. Гамалеевка, ливни стоки, стоки из частных гаражей и усадеб, расположенных в прибрежной полосе реки, и стоки казенного завода «Звезда». В результате изучения видового состава микроскопических водорослей были обнаружены и определены 34 вида данных организмов. Наиболее численно были представлены видовые спектры зеленых и диатомовых водорослей, соответственно 12 и 13 видов в группах. В видовом спектре планктона доминирующими были диатомовые, зеленые и синезеленые водоросли. В пробах перифитон количественно преобладали зеленые и сине-зеленые водоросли, однако массового развития видов сине-зеленых водорослей, основных возбудителей «цветения» воды, обнаружено не было. Видовой состав фитобентоса представлен 10 видами, которые по общему количеству в три раза уступали фитопланктона.
В целом, сапробиологичний анализ по индикаторным организмами показал умеренное загрязнение воды, что соответствовало ?-мезосапробний зоне. Данная зона характеризуется присутствием аммиака и продуктов его окисления — азотной и азотистой кислот. Сероводород встречается в незначительном количестве, аминокислот нет, кислорода в воде много, минерализация идет за счет полного окисления органического вещества.
Работа по исследованию состояния водной экосистемы реки Шостка продолжается, однако уже сейчас можно указать на необходимость повышения эффективности работы очистных сооружений, сокращение сброса неочищенных сточных вод, а также строительства новых канализационных станций.